高中生侦探工藤新一,有一天与青梅竹马毛利兰到公园玩,无意间看到两名行动诡异的黑衣人,工藤新一在跟踪时,因为一时大意被同伙从背后袭击,随即被灌下了毒药,当他醒来时…… 虽然身体缩小,但头脑依旧灵活,从此工藤新一化身成为江户川柯南寄宿在毛利兰家里,暗中调查黑衣组织,并且寻找解药。 在这段时间里,工藤新一遇见了同样是服用了毒药的宫野志保,变小后化名灰原哀,(原黑衣组织成员,代号:sherry,雪莉。) aptx4869,全称apoptoxin4869(日文:アポトキシン4869),是由黑衣组织成员宫野志保开发出的新型毒品,而她与工藤新一服下的,正是此毒药的半成品。 宫野志保因为不满组织杀害了自己的至亲,便决定脱离组织因此被囚禁,而她正是服下了毒药才逃了出来,并且一直在躲避着组织成员琴酒的追杀! …… 不久后,经过灰原哀的努力,便研发出了aptx4869的半成品解药,是由白干中提取的成分,不过限制只有二十四小时。 工藤新一为了隐藏身份,请灰原哀假扮成江户川柯南,而他便服下了解药半成品,变回了高中生模样,暂时解除了兰的疑虑。 只是,由于工藤新一在校园里推理解决了一桩案子而大出风头,以至于身份暴露,更在修学旅行的时候,真面目出现在了电视上。 为此,黑衣组织也愈发确认,那个高中生侦探根本就没有死,只是变成了小学生,并且化名为江户川柯南。 …… “哼!侦探游戏该结束了,工藤新一!” 琴酒与伏特加守在毛利侦探事务所门口,看着毛利兰牵着一个小孩走了出来,顿时间露出了阴冷的目光。 “嗯?” 此时,柯南也感受到了一股杀气,头皮发麻,背后直冒冷汗。 “柯南,你怎么了?” 毛利兰看着他满头大汗的样子,略显担忧,俯下身子道:“柯南,你是不是身体不舒服啊?” “啊?没有了,小兰姐姐。” 柯南被毛利兰直视着,有些羞涩的敷衍道。 “不好...